Natalia Pérez Cordero es egresada de la Facultad de Derecho de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM). Cuenta con diversos diplomados sobre derechos humanos y los sistemas regionales de derechos humanos.

Desde el 2010 ha trabajado en temas relativos a la protección de derechos humanos, primero como becaria del Instituto de Investigaciones Jurídicas (2010-212) investigando temas relativos al sistema interamericano de derechos humanos. Posteriormente se dedicó a la defensa y acompañamiento de casos de violaciones graves a derechos humanos, como tortura, desaparición forzada y ejecución extrajudicial desde la Comisión Mexicana de Defensa y Promoción de Derechos Humanos. También participó como dictaminadora para el Tribunal Permanente de los Pueblos en su capítulo México, en la post audiencia relativa a la devastación ambiental en el centro de México. Ha escrito diversas columnas y ha impartido diversos cursos en materia de derechos humanos, particularmente en temas como sistema interamericano de derechos humanos, desaparición forzada, tortura y violencia de género.